Φυσικό αποκορύφωμα των διεργασιών για το διαχωρισμό από τη Ρωσική Ορθόδοξη Εκκλησία του θρόνου Κωνσταντινουπόλεως και να γίνει ανεξάρτητη δομή Ρωσική Εκκλησία ήταν η ίδρυση του Πατριαρχείου στη Ρωσία. Η εκδήλωση αυτή προκαθορίζεται από τις δύο υποκειμενικών και αντικειμενικών παραγόντων της φυσικής ιστορικής εξέλιξης.
Η αποδοχή του βαπτίσματος, της Ρωσίας σε πολλά θέματα οργάνωσης εκκλησίας εξαρτάται από την Κωνσταντινούπολη. Πρώτα μητροπολίτες στη Ρωσία αυξήθηκαν έστειλε τους Έλληνες που δεν ήθελαν τους Ρώσους πρίγκιπες. Ήδη Yaroslav Mudry προσπάθησε να σταματήσει αυτή η πρακτική, σήκωσε χωρίς άδεια από τον Πατριάρχη Κωνσταντινουπόλεως στο μητροπολιτικό τμήμα Ιλαρίωνα, της Ρωσίας από τη γέννηση. Παρά το γεγονός ότι λόγω των αντιξοότητες της εξωτερικής πολιτικής η καινοτομία αυτή δεν κράτησε πολύ (από 1051 σε 1555 χρόνια) μετά Yaroslav εγγόνια επέστρεψε στο Μητροπολίτη της Ρωσικής επιλογής. Κατά τη διάρκεια του φεουδαρχικού κατακερματισμού Ορθόδοξη Εκκλησία συμβάλει στην ενότητα της ρωσικής εδάφη γύρω από μια κοινή πίστη. Σημαντικό ρόλο στη μετατροπή της Μόσχας στο κέντρο της ενοποίησης όλων των ηγεμονιών έπαιξε μετεγκατάσταση σε μητροπολιτικό. Η περαιτέρω ανάπτυξη του ρωσικού κράτους (με την θεωρία του «Μόσχας - η Τρίτη Ρώμη») καθόρισαν την ίδρυση του Πατριαρχείου στη Ρωσία. Ένωση της Φλωρεντίας το 1439, το οποίο ανακήρυξε την ένωση του καθολικισμού και της Ορθοδοξίας, απορρίφθηκε από τις ρωσικές ιεράρχες, επιτρέποντας Μητροπολίτης Ιωνάς και τους δέκτες του μέχρι τώρα διαμόρφωση του μέλλοντος της εκκλησίας. Όμως, η ίδρυση του πατριαρχείου στην ίδια τη Ρωσία ήταν μόλις 150 χρόνια αργότερα: στις πιο δύσκολες συνθήκες της κοινωνικής και οικονομικής κρίσης από την οπρίτσνινα και Livonian Πολέμου.
Τσάρος Φιοντόρ Ιβάνοβιτς, δεν είναι ούτε ένα κοφτερό μυαλό, χωρίς ενεργό εσωτερικής πολιτικής, αλλά ευσεβείς και tserkovnoposlushny, το 1586 θέτει το ζήτημα της πλήρους ανεξαρτησίας της Ρωσικής Ορθόδοξης Εκκλησίας της Κωνσταντινουπόλεως πέσει. Οι περισσότεροι ερευνητές επισημαίνουν ότι δεν έχει υπάρξει χωρίς την επιρροή σύμβουλος Fedor - Μπορίς Γκοντουνόφ, το κράτος έχει ένα αξιόλογο ταλέντο. Χρειάστηκαν πολλά χρόνια για την έγκριση μιας τέτοιας ενέργειας με την τρέχουσα πατριάρχη, οπότε η ίδρυση του Πατριαρχείου στη Ρωσία σημειώθηκε το 1589, όταν ο Πατριάρχης Κωνσταντινουπόλεως Ιερεμίας χειροτονήθηκε σε ένα τόσο υψηλό ιερατείο της εργασίας, ο προστατευόμενός Borisa Godunova.
Από τότε η Ρωσική Εκκλησία έγινε πραγματική και ονομαστική εντελώς ανεξάρτητο οργανισμό. Μπορούμε να πούμε ότι Godunov και οραματιστής σχέδια έχουν δικαιωθεί πλήρως, από την ίδρυση του Πατριαρχείου στη Ρωσία συνέβαλαν στην ενθρόνιση του. Αυτή η εργασία ως θρησκευτικός ηγέτης, έπαιξε ρόλο σε αυτό. Κατά τη διάρκεια και μετά τις ταραχές Ινστιτούτο Πατριαρχείο στη χώρα μας όλο και πιο εντατική, λόγω της αστάθειας της κοσμικής εξουσίας. Σύντομα κοσμική και πνευματική εξουσία ήρθε σε έντονη μάχη που κέρδισε το βασιλιά. Τέλος δομή εκκλησία υποβλήθηκε σε πλήρη αναδιάρθρωση σύμφωνα με τον Peter Μέγας. Πάνω από τα επόμενα 200 χρόνια στην κεφαλή της εκκλησίας ήταν μια δημόσια αρχή - η Ιερά Σύνοδος. Ο νέος θεσμός του Πατριαρχείου της Ρωσίας έλαβε χώρα μετά την ανατροπή της μοναρχίας το 1917, όταν επιλέχθηκε το Τοπικό Συμβούλιο του Πατριάρχη Τύχωνα. Προς το παρόν, η Ορθόδοξη Εκκλησία με επικεφαλής τον Κύριλλο, και συνεχίζει να διαδραματίζει σημαντικό ρόλο στην πνευματική και κοινωνική ανάπτυξη της Ρωσίας.